Un génotype individuel en 10 minutes

Pour bon nombre de technologies, il existe un point de basculement où l’on passe de la phase confinée, en laboratoire, à la phase ouverte, orientée vers le grand public et prenant la forme d’offres commerciales. Nous vivons en ce moment même cette transition pour la génomique personnelle. Les conférenciers du colloque Cold Spring Harbor Personal Genomes l’ont évoquée en début de ce mois, autour du Prix Nobel James Watson, l’un des quatre individus dont le génotype a été intégralement séquencé à ce jour. Mais ce chiffre promet de connaître une hausse exponentielle à mesure que les coûts s’abaissent. Nous parlions récemment de l’offre à venir de la société Complete Genomics (génotype individuel complet pour 5000$ en 2009). Au meeting du Cold Spring Harbor Laboratory, la société Pacific Biosciences a donné quelques informations sur son travail actuel, visant à développer des séquenceurs haute vitesse capable d’aligner toutes les paires de bases d’un génome humain… en dix minutes ! Les chercheurs ont également évoqué le Personal Genome Project, qui a pour ambition de séquencer et de rendre publics 100.000 génotypes personnels. Hier, le PGP a rendu public les données des dix premiers volontaires, tous scientifiques (Misha Angrist, Keith Batchelder, George Church, Esther Dyson, Rosalynn Gill, John Halamka, Stan Lapidus, Kirk Maxey, Steven Pinker et James Sherley).